Manajemen B2TKE terdiri atas Pejabat Struktural mulai dari Eselon II sampai Eselon IV dan kelompok jabatan fungsional sesuai Perka BPPT No 012 Tahun 2015. Selain itu dibentuk juga Manajemen Mutu yang berfungsi untuk melakukan peningkatan dan pengendalian mutu kegiatan di B2TKE dan bertanggung jawab langsung kepada Kepala B2TKE.

Struktur Organisasi B2TKE

 
 
No Jabatan Eselon Nama
1 Kepala B2TKE II Dr. Ir. Barman Tambunan
2 Koord Bag Umum   Winarni, SE
3 Koord Bid Layanan Jasa Teknologi   Ir. Andri Subandriya, M.Si
4 Koord Bid Teknologi Kelistrikan   Ir. Riza, M. Eng
5 Koord Bid Konversi Energi   Dr. Ir. Cahyadi, M.Kom
6 Sub Koord TUSDM & RT   Sumanto, SE
7 Sub Koord Program & Keuangan   Sugeng, ST., MT
8 Sub Koord Layanan Jasa   Dian Khairiani, A.Md
9 Sub Koord Pengelolaan Technopark Energi   Saiful Mukhid, S.P